Advaita Bio запустила iSCanGuide — единую платформу для анализа одноклеточной и пространственной транскриптомики на базе инфраструктуры с GPU-ускорением

Компания Advaita Bio объявила о запуске iSCanGuide — облачной платформы, предназначенной для преобразования крупных наборов данных одноклеточной и пространственной транскриптомики в биологически значимые результаты. Платформа, опирающаяся на 20-летний опыт научно подтвержденных разработок, интегрирована с флагманским решением Advaita — iPathwayGuide  — и заменяет разрозненные рабочие процессы единой аналитической средой на базе графического процессора.

Одноклеточная и пространственная транскриптомика генерируют сложные массивы данных, однако большинство исследователей по-прежнему вынуждены комбинировать множество разрозненных инструментов для их анализа, писать собственные скрипты, переносить данные между платформами и тратить недели на ручные рабочие процессы. iSCanGuide устраняет это узкое место благодаря единой среде с ускорением на базе графического процессора, позволяющей выполнять задачи, ранее занимавшие недели, всего за несколько минут и опирающейся на те же научно подтвержденные алгоритмы, что и система анализа сигнальных путей Advaita, которой доверяют более 13.000 исследователей во всем мире.

«Исследователи буквально утопают в потоке данных и испытывают острый дефицит аналитичеcких выводов, — считает Майк Маттакола (Mike Mattacola), генеральный директор Advaita Bio. — iSCanGuide сокращает процесс, который раньше занимал недели ручной работы, до нескольких минут — от матриц подсчетов до аннотированных типов клеток, пространственного контекста и механистического анализа сигнальных путей на единой платформе».

«Одноклеточный и пространственный анализ долгое время оставались крайне фрагментированными — слишком много инструментов, слишком много параметров и отсутствие преемственности между кластеризацией и биологической интерпретацией. Сложность освоения подобных инструментов приводит к тому, что критически важные ноу-хау уходят вместе со специалистами-аналитиками, а обмен результатами остается неоправданно сложным, — говорит д-р Сорин Драгичи (Sorin Draghici), основатель и главный научный специалист компании. — iSCanGuide заменяет все это единой платформой, которая переносит исследователей от матриц подсчетов экспрессии к механистическому пониманию сигнальных путей — с разумными настройками по умолчанию, возможностью обмена результатами одним нажатием кнопки и фиксацией всех параметров анализа. Прямая интеграция с собственной методологией Impact Analysis iPathwayGuide позволяет выполнять весь рабочий процесс за считанные минуты, а не за недели».